Управління закладом освіти здійснюється його засновником згідно ст.24 Закону України "Про освіту". Засновником ДНЗ №253 є територіальна громада міста Запоріжжя в особі Запорізької міської ради. Органом управління ДНЗ №253 є департамент освіти і науки Запорізької міської ради та його відокремлений структурний підрозділ - територіальний відділ освіти Заводського району департаменту освіти і науки Запорізької міської ради відповідно до повноважень, визначених Положенням про департамент освіти і науки Запорізької міської ради та Положенням про територіальний відділ освіти Олександрівського, Вознесенівського, Дніпровського, Хортицького, Заводського, Шевченківського, Комунарського району департаменту освіти і науки Запорізької міської ради.

Безпосереднє керівництво роботою ЗДО №253 здійснює його  завідувач. Постійно діючий колегіальний орган в ЗДО №253 - педагогічна рада. Органом громадського самоврядування ЗДО №253 є загальні збори колективу закладу та батьків, або осіб, які їх замінюють. У період між загальними зборами діє рада ЗДО №253.